Нет, вы можете оформить МЧД на сайте ФНС. Как показывает практика, на это уходит намного больше времени, потому каждый раз нужно вручную заводить все данные по организации, доверенному лицу и руководителю. СБИС все заполняет за вас автоматически и выдает МЧД через 1 минуту.
При оформлении МЧД на сайте налоговой, вы можете подгрузить документ в СБИС